Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

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Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp408H7BX78 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Zfp408H7BX78 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Zfp408H7BX78 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms