Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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