Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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