Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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