Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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H2-M1F7CXU4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M1F7CXU4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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