Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms