Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms