Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms