Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms