Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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