Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap46E9Q2C0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms