Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms