Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms