Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms