Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rdh8D3Z6W3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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