Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc170D3YXL0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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