Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms