Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cttnbp2B9EJA2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms