Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11cB4XVP9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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