Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6133B2RY53 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms