Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms