Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PtprbB2RU80 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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PtprbB2RU80 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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