Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms