Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms