Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms