Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms