Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AgrnA2ASQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AgrnA2ASQ1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AgrnA2ASQ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AgrnA2ASQ1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AgrnA2ASQ1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AgrnA2ASQ1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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AgrnA2ASQ1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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AgrnA2ASQ1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AgrnA2ASQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AgrnA2ASQ1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AgrnA2ASQ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AgrnA2ASQ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AgrnA2ASQ1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AgrnA2ASQ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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AgrnA2ASQ1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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