Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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Rtf1A2AQ19 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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