Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin4A2AMM0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms