Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lcn6A2AJB9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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