Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms