Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms