Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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