Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms