Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
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