Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms