Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms