Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms