Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms