Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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