Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RfxankQ9Z205 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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RfxankQ9Z205 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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RfxankQ9Z205 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RfxankQ9Z205 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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