Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms