Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.3 ms