Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn13Q9Z0S4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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