Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tusc2Q9WVF8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tusc2Q9WVF8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms