Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms