Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ptpn4Q9WU22 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ptpn4Q9WU22 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn4Q9WU22 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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