Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam50bQ9WTJ8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms