Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms