Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0P4

Smap, Small acidic protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmapQ9R0P4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmapQ9R0P4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmapQ9R0P4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms